呢個站一共有2層樓嘅地下區域，其中地下1樓係站廳，有票務設施，客務中心同商鋪；地下2樓係7號綫月台。雖然車站冇休息室，但廁所喺月台西邊。
員崗站嘅站廳收費區喺車站南邊，北邊係過街通道。收費區有好多部扶手電梯同樓梯、專用𨋢往返月台都得。
呢個站有一個島式月台，喺興南大道嘅員崗路口地底。
另外，喺呢個站東邊有條存車線，若果7號綫東邊出現冬瓜豆腐嘅話，去大學城南啲車都會攞呢度做總站，之後喺呢條存車線返轉頭。屆時去板橋同大學城南啲乘客要轉其它交通工具先至可以到。
呢個站得好少商舖同自助服務，凈得間便利店同麵包糕餅舖。自助服務凈得臺自動影相機、販賣機同好易機響度。
- 商舖
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- 自助服務
- 好易（Hotye）多媒體自助服務終端
- 自動販賣機
- 自動影相機
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| 員崗站冚唪唥嘅出入口 |
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 B出入口 | B出入口 |
 E出入口 | E出入口 |
 G出入口 | G出入口 |
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呢個站有6個出入口，分别係A、B、C同E、F、G。但係F出入口因為起緊商業建築而暫時未開通。
| 冧巴 |
標記 |
方位 |
去到邊度
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出入口A   |
興南大道 |
西南 |
員崗巴士站（東行）
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| 出入口B |
興南大道 |
東南偏東 |
員崗巴士站（東行）
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| 出入口C |
興南大道 |
東南 |
地鐵員崗巴士站（東行）
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| 出入口E |
興南大道 |
東北偏東 |
廣東省婦幼保健院（番禺院區）、地鐵員崗巴士站（西行）、省婦幼保健院（峻新大道）巴士站
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| 出入口F |
未開通 |
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唔好喺呢個出入口出入
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| 出入口G |
興南大道 |
西北 |
員崗巴士站（西行）
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註： 有盲人引導徑 |  有輪椅升降臺 |  有斜道 | 有專用
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| 行去邊頭 |
頭班車 |
尾班車
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| 每日
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| 7號綫
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| 美的大道站 |
06:08 |
23:25
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| 燕山站 |
06:06 |
23:24
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| 姬堂站 |
06:06 |
23:49
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注意：
喺晚黑最後一班車開走之前嗰5分鐘之內，
係唔畀入閘坐車（包括埋買車飛）。
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呢個站喺2003年嘅廣州地鐵規劃入面出現，嗰時喺興南大道出現咗官堂站同金坑站呢兩個站，位置分別喺官堂村同埋金新大道口。後嚟7號綫喺金坑站以東路段先後改咗2次規劃，直到2010年底嘅規劃定咗到大學城南之後，由於加強南大幹線嘅連接而改喺興南大道位，令官堂站因為冇位起嘅理由而取消咗金坑站[1]。
2014年7月15號，廣州市民政局同廣州地名網同時公佈咗7號綫一期嘅站名，呢個站亦改名做員崗站[2]。
- 2014年11月28號，車站正式喐手起[3]。
- 2015年8月12號，車站正式封頂[4]。
2016年12月28號12:00，7號綫開通一期段時，車站亦正式開通。
員崗站附近都係雅居樂樓盤同員崗村、陳邊村等好多個城中村響度，加上附近有好多個工業區響度，所以上落班高峰期比較多人上落。
喺節假日間或週末，亦有乘客喺呢個站出站轉巴士到餘蔭山房景區玩。
有輪椅升降臺 | 
有斜道 | 
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