新竹市政府(英文:Hsinchu City Government)係中華民國新竹市最高層級嘅地方行政機關,喺中華民國政府架構中為市自治嘅行政機關,同時負責執行中央機關委辦事項,新竹市嘅自治監督機關為行政院各部會(主要為內政部)。新竹市政府設有15個內部單位、6個所屬一級機關(設有12個下屬機關)、3個區公所、15個所屬二級機關、14所各級學校、1所幼兒園。