水質污染包括海港、河流同海灣嘅污染，大部份都係由人類造成。當人類嘅排泄物、工廠排出嘅污水、耕種用嘅農藥或洗車嘅清潔劑，如果無將呢啲廢料用適當嘅方法處理就排出到大海，就會影響到水質。令到海港內嘅海水無論係含氧量、透光度、重金屬嘅含量等都無咁理想。海港間中發生紅潮事件。
